Аэропорт Кишинэу ставит перед собой цель проконтролировать, изменить и, соответствующим образом, компенсировать вредное воздействие на экологию. Следующие принципы играют важную роль в мониторинге воздействия на окружающую среду в результате развития Аэропорта:

1. ограничение шумового воздействия и, по возможности, его постепенное сокращение;
2. сохранение качества местного воздуха в допустимых пределах, с целью защиты здоровья людей и окружающей среды;
3. по возможности, предупреждение  разрушения ландшафта или минимизация данного процесса;
4. соблюдение всех соответствующих стандартов качества воды и других обязательных стандартов охраны окружающей среды;
5. проектирование наземного доступа к Аэропорту таким образом, чтобы ограничить воздействие на окружающую среду;
6. минимизация воздействия на биологическую среду.

Строительство многоярусной парковки предусматривает ограниченное воздействие на окружающую среду.

Экологический аудит показал, что текущие экологические показатели Аэропорта соответствуют нормативным требованиям. По результатам качественной оценки экологического и социального воздействия было установлено, что при условии применения предусмотренных мер по смягчению и мониторингу, воздействие на окружающую среду, связанное с развитием Аэропорта, будет незначительным.

Аэропорт Кишинэу строго применяет все необходимые меры, в полном объесме соблюдая требования по безопасности, международные обязательства, а также техническую и экономическую обоснованность.

В начале 2011 года, Международный Аэропорт Кишинев получил Сертификат аккредитации в области сокращенных выбросов углекислого газа. Данное событие представляет собой официальное признание усилий Аэропорта на защиту окружающей среды, и включение такового в избранный клуб аэропортов с низким уровнем вредных выбросов, вследствие деятельности аэропорта. Полученный статус, соответствующего нормам выбросов CO2, является европейским стандартом.