Aeroportul Chişinău are drept scop monitorizarea, diminuarea şi compensarea, în mod corespunzător, a impactului advers asupra mediului. Fundamentale pentru controlul impactului asupra mediului ca şi consecinţă a dezvoltării Aeroportului sînt următoarele principii:

1. poluarea fonică să fie limitată şi redusă treptat, în limita posibilităţilor;
2. calitatea aerului local să fie menţinută conform normelor stabilite pentru a proteja sănătatea oamenilor şi mediul ambiant;
3. în măsura posibilităţilor, influenţa negativă asupra landşaftului să fie evitată, sau redusă la maximum;
4. toate standardele relevante privind calitatea apei şi celelalte standarde de protecţie a mediului ambiant să fie respectate;
5. accesul terestru la Aeroport să fie proiectat astfel, încît să reducă efectele nefaste asupra mediului;
6. impactul asupra biodiversităţii să fie minimizat.

Construirea parcării auto supraetajate va avea un impact limitat asupra mediului înconjurător.

Auditul mediului înconjurător a demonstrat că indicii ecologici curenţi ai Aeroportului se încadrează în limita normelor stabilite. Conform rezultatelor evaluării calitative a impactului asupra mediului ambiant şi sferei sociale, s-a stabilit că, atît timp cît măsurile de diminuare şi monitorizare vor fi implementate, influenţa asupra mediului, generată de dezvoltarea aeroportuară, nu va fi semnificativă.

Este de menţionat că Aeroportul Chişinău respectă cu rigurozitate cerinţele de securitate, obligaţiile internaţionale, precum şi fezabilitatea tehnică şi raţionalitatea economică.

La începutul anului 2011, Aeroportul Internaţional Chişinău a obţinut Certificatul de Acreditare privind emisiile reduse de CO2. Evenimentul în cauză reprezintă recunoaşterea oficială a eforturilor Aeroportului vizavi de protecţia mediului ambiant, acesta devenind un membru al clubului select al aeroporturilor care se disting printr-un nivel redus de emisii ale poluanţilor atmosferici, rezultate în urma activitatăţii aeroportuare. Acreditarea privind emisiile reduse de CO2 este un standard european pentru aeroporturi.